えっ。なんだろう…その状態を再現できません。
・画面は最大化されてますね?
・塗りの左側アイコンは☆印(シェイプを作成)が選ばれてますか。
・画面右上のワークスペース>標準 でしょうか。
・ワークスペース>「標準」をリセット 押すとどうですか?
・新規プロジェクト・新規コンポジションでも出ませんか。
・新規でダメなら環境設定フォルダ「13.0」削除してみますか。
C:\Users\<ユーザ名>\AppData\Roaming\Adobe\After Effects\13.0
の「13.0」フォルダごと削除してください(リセットされます)。
・細かいバージョンはなんでしょうか。
ヘルプ>After Effectsについて...>画面左下
バージョン 13.0.1は不具合がありましたがそれではないですよね?